在澳大利亚大堡礁海域，小丑鱼马林因为一次意外失去了妻子和几乎所有孩子，从此变得胆小怕事，对唯一幸存的儿子尼莫严加看管。正值青春叛逆期的尼莫为了证明自己，故意游向一艘渔船，结果被潜水员抓走，关进了悉尼一名牙医办公室的鱼缸里。马林不得不克服内心最大的恐惧，与一条患有短期失忆症的蓝唐王鱼多莉结伴，踏上横跨大洋的寻子之旅。他们遭遇了三只鲨鱼的“戒肉聚会”、水母大军的致命袭击、被鲸鱼吞入腹中，以及一只自称“鱼友”的搞笑海鸥的误导。最终，马林学会了信任与放手，而尼莫也理解了父亲的爱。
皮克斯黄金时代的代表作，将父子情深与海底冒险完美结合。角色塑造极其成功，多莉堪称动画史最可爱的配角之一。情感真挚动人，笑泪交织，温子仁的导演（误，实则安德鲁·斯坦顿）将水下世界的美与险都展现得淋漓尽致。
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